КУКС запаса. В апреле 1941 г. назначен зам. командира 124-й стрелковой дивизии КОВО в г. Горохов. Начало Великой Отечественной войны встретил в той же должности. Дивизия в составе 27-го стрелкового корпуса 5-й армии Юго-Западного фронта в ходе приграничного сражения с первого же дня вела тяжелые оборонительные бои на гороховском направлении, опираясь на сооружения укрепленного района № 4. К концу первого дня войны, понеся большие потери, ее остатки вели бои в окружении, имея ничтожные запасы боеприпасов и продовольствия. После выхода из окружения с 15 июля 1941 г. полковник Е. Ф. Макарчук командовал 227-й стрелковой дивизией в 26-й армии, которая вела бои на винницком направлении вост. Проскурова. В ходе Киевской оборонительной операции она участвовала в контрударах, проводимых армией южнее Киева по соединениям 1-й немецкой танковой группы. С середины сентября в составе армии вела бои в окружении. После выхода в конце сентября полевое управление армии было расформировано, а дивизия подчинена 40-й армии и в ее составе продолжала вести оборонительные бои на р. Десна. В боевой характеристике на полковника Е. Ф. Макарчука, составленной командующим 26-й армией генерал-лейтенантом Ф. Я. Костенко 8 августа 1941 г., было отмечено, что он «…приняв самую неустойчивую и распущенную дивизию среди войск армии, сумел быстро превратить ее в организованное боевой соединение. В сложной обстановке ориентируется, обладая твердой волей и организаторскими способностями ». В конце октября 1941 г. он был ранен, после излечения зачислен в распоряжение Военного совета 40-й армии Юго-Западного фронта. Затем исполнял должность начальника курсов младших лейтенантов фронта, а с 10 декабря 1941 г. был начальником резерва начсостава фронта. В марте 1943 г. откомандирован в распоряжение командующего войсками УрВО, где ему было поручено сформировать 233-ю стрелковую дивизию. В середине апреля формирование дивизии было прекращено и он вернулся в распоряжение ГУК НКО. 18 апреля 1942 г. вступил в командование 91-й стрелковой дивизии СКВО. С июня она в составе 51-й армии Северо-Кавказского фронта вела тяжелые оборонительные бои на цимлянском направлении. В июле 1942 г. полковник Е. Ф. Макарчук был отстранен от командования дивизией и зачислен в распоряжение Военного совета СКВО. 2 августа 1942 г. назначен командиром сводного отряда 51-й армии, входившей в состав Сталинградского, а с 7 августа – Юго-Восточного фронтов. Отряд под его командованием выполнял задачи по обороне станции и пос. Зимовники, где стоял штаб армии. В течение 6-8 августа он стойко оборонял занимаемые позиции и отошел лишь по приказу командующего армией. За эти бои полковник Е. Ф. Макарчук был награжден орденом Красного Знамени (5.11.1942). В том же месяце принял командование 344-м стрелковым полком 138-й стрелковой дивизии 51-й армии, а с 10 сентября 1942 г. допущен к временному командованию 302-й стрелковой дивизией. Ее части в это время находились в районе Ханата, Харгота, где приводили себя в порядок после предыдущих напряжннных боев. С 25 сентября 1942 г., после пополнения личным составом и вооружением, дивизия вела наступательные бои против