являлся слушателем Казанской высшей военной объединённой школы. С 1923 г. помощник, командир роты, командир батальона в 7-й Казанской и Краснодарской пехотных школах, командир 508-го чрезвычайного отряда особого назначения (в этом качестве с августа по октябрь 1925 года принимал участие в подавлении восстания горцев в Чечне и Дагестане), помощником командира 39-го и 37-го стрелковых полков 13-й стрелковой дивизии. В 1929 г. окончил тактические курсы «Выстрел» имени Коминтерна. С 1929 г. помощник командира 221-го стрелкового полка 74-й стрелковой дивизии. С 30 апреля 1931 г. командир и военный комиссар 82-го горнострелкового полка 28-й Горской горнострелковой дивизии СКВО. С 12 февраля 1934 г. командир 61-го стрелкового полка 21-й Пермской стрелковой дивизии ОКДВА. С декабря 1936 г. начальник штаба 66-й стрелковой дивизии ОКДВА. С 8 августа 1937 г. командир 21-й Пермской стрелковой дивизии ОКДВА. С октября 1937 г. одновременно временно исполняющий должность командира 43-го стрелкового корпуса. С июня 1938 г. командир 43-го стрелкового корпуса ОКДВА. В 1941 г. окончил курсы усовершенствования высшего начсостава при Академии Генерального штаба РККА и с 3 июня 1941 года командовал размещённым вдоль границы по рубежу реки Дубиса 22-м стрелковым корпусом (11-я армия, Прибалтийский Особый военный округ. Утром 22 июня основные силы группы армий «Север» под командованием фельдмаршала фон Лееба, перейдя в наступление, нанесли мощный удар по позициям 22-го стрелкового корпуса. Удар группы армий «Север» был настолько сильным, что командир корпуса сразу потерял связь с командующим 11-й армией генералом В. И. Морозовым, а корпус начал отступать, понеся потери, на Каунас и Вильнюс. В следующие дни плохо управляемые и организованные части 22-го стрелкового корпуса с боями стали отступать в Псковском направлении. К середине июля подразделения группы армий «Север» прорвались в районы городов Шимск и Луга. Многие представители Ставки Верховного Главнокомандования считали, что Александр Ксенофонтов был виновен в неудачах первых недель войны корпуса. Это мнение имело бы печальные последствия, если бы не организация Ксенофонтовым обороны 22-го стрелкового корпуса на Лужском рубеже и проведение другими подразделениями 11-й армии контрнаступления с 14 по 18 июля из районов городов Уторгош и Дно на Сольцы, в результате которого немецкие войска были отброшены на 40 километров на запад. В результате этих действий наступление немецких войск было приостановлено вплоть до 10 августа. С августа 1941 г. заместитель командующего 11-й армией. Когда 15 августа гитлеровцы взяли Новгород, Ксенофонтов организовал внезапный контрудар из района южнее Старой Руссы, и советские войска, продвинувшись на 60 километров, создали угрозу Новгородской группировке противника. В результате этих действий командование группы армий «Север» перебросило с Ленинградского направления дополнительные силы. В результате переброски немецких войск с этого направления было замедлено генеральное наступление войск группы армий «Север» на Ленинград. 13 сентября 1941 г. был тяжело ранен и эвакуирован в госпиталь. После выписки из госпиталя в декабре 1941 года генерал-майор