командира и врид командира батареи 9-го легкого артиллерийского дивизиона, с ноября 1924 г. – командиром батареи 48-го легкого артиллерийского дивизиона, с августа 1925 г. – командиром батареи 25-го Черкасского стрелкового полка. С ноября 1926 г. служил в 9-м артиллерийском полку этой же дивизии (переименован затем в 9-й корпусной), и.д. помощника командира и врид командира дивизиона, командира учебного дивизиона. В декабре 1932 г. зачислен слушателем в Артиллерийскую академию РККА им. Ф.Э. Дзержинского, по ее окончании в декабре 1937 г. назначен преподавателем артиллерии Оренбургского училища зенитной артиллерии. С августа 1938 г. состоял в запасе РККА (причина увольнения неизвестна), работал преподавателем математики в Таганрогском педагогическом училище и в Таганрогском авиатехникуме. В октябре 1939 г. вновь определен в кадры Красной Армии и назначен старшим преподавателем артиллерии Горьковского училища зенитной артиллерии им. В.М. Молотова. В июле 1940 г. майор Н.Н. Плужников был переведен в Бакинское училище зенитной артиллерии на должность руководителя артиллерии, затем в апреле 1941 г. назначен начальником штаба Закавказской зоны ПВО. С началом Великой Отечественной войны в той же должности. В состав Закавказской зоны ПВО входили 3-й корпус ПВО (г. Баку), 8-я бригада ПВО (г. Батуми), Тбилисский бригадный район ПВО. Соединения и части Закавказской зоны ПВО осуществляли прикрытие от воздушного противника войск, военных и промышленных объектов на территории округа, важнейших промышленных центров Кавказа – городов Баку, Махачкала, Грозный, Краснодар и других, портов черноморского побережья. Кроме того, они также вели борьбу с разведывательной авиацией противника, совершавшей уже с 25 июня 1941 г. разведывательные полеты в границах зоны. В августе – сентябре 1942 г. полковник Н.Н. Плужников был командирован в составе оперативной группы штаба Закавказской зоны ПВО для организации ПВО промышленных объектов порта и города Сухуми. В результате успешно проведенной работы уже 25 сентября 1942 г. при налете на г. Сухуми 13 немецких самолетов Ю-88 организованным огнем частей ПВО боевые порядки вражеской авиации были расстроены, при этом сбито 2 бомбардировщика. В ноябре того же года полковник Н.Н. Плужников был командирован в Грозненский дивизионный район ПВО. Здесь он принимал участие в организации отражения частями зенитной артиллерии как воздушных, так и наземных сил противника, прорвавшихся к г. Орджоникидзе. В боях за г. Орджоникидзе только огнем 454-го зенитно-артиллерийского полка ПВО было уничтожено 7 вражеских танков, 13 автомашин (4 из них с боеприпасами), разрушен 1 дзот, подавлен огонь 13 батарей противника. Приказом по войскам Закавказского фронта от 15.2.1943 г. за успешное выполнение заданий командования в этих боях полковник Н.Н. Плужников был награжден орденом Отечественной войны 2-й степени. С 3 сентября 1943 г. временно и.д. заместителя командующего по зенитной артиллерии, он же командующий артиллерией Закавказской зоны ПВО (утвержден в должности с 9.02.1944 г.). С июля 1944 г. и до конца войны занимал должность