на новые штаты, назначен пом. заведующего экономическим кабинетом. В июле он убыл в СКВО на должность политрука роты в 37-й стрелковый полк 13-й Дагестанской стрелковой дивизии (г. Махачкала), с ноября 1925 г. исполнял должность инструктора политотдела дивизии. В декабре 1929 г. переведен в 5-ю Ставропольскую кавалерийскую дивизию им. М. Ф. Блинова в г. Ставрополь. Здесь проходил службу в политотделе дивизии в должностях начальника агитационно-пропагандистской части, старшего инструктора и врид зам. начальника политотдела. С апреля 1931 г. по октябрь 1934 г. – слушатель Военно-политической академии РККА в Ленинграде, после окончания которой назначен старшим инструктором политотдела 7-го механизированного корпуса ЛВО. С октября 1936 г. исполнял должность старшего инструктора агитационно-пропагандистской работы политотдела 4-й отдельной тяжелой танковой бригады КОВО в г. Киев. В сентябре 1937 г. переведен на должность военкома 134-й отдельной легкотанковой бригады 25-го танкового корпуса. В ее составе участвовал в походе Красной армии в Зап. Украину. Приказом по войскам округа от 21 сентября 1940 г. полковой комиссар С. И. Якимов был допущен к исполнению должности военкома 81-й моторизованной дивизии 4-го механизированного корпуса 6-й армии, дислоцировавшейся в г. Львов. В начале Великой Отечественной войны дивизия участвовала в приграничном сражении на Юго-Западном фронте, действуя северо-западнее Львова. В период с 28 июня по 5 июля полковой комиссар С. И. Якимов исполнял должность командира этой дивизии. Участвуя в Киевской оборонительной операции, она потеряла значительную часть боевой техники, в связи с чем 29 июля была переформирована в 81-ю стрелковую. Ведя боевые действия, находясь первоначально в непосредственном подчинении командующего войсками Юго-Западного фронта, а позже 21-й армии, дивизия была окружена и вынуждена прорываться в направлении Прилук к р. Псел. В этих боях 23 сентября С. И. Якимов был тяжело контужен и самолетом эвакуирован в г. Горький. Три месяца находился на излечении в госпитале. После выздоровления, в январе 1942 г., назначен военкомом Управления вузов бронетанковых и механизированных войск РККА. С июля 1943 г. – зам. начальника по политической части Главного управления продовольственного снабжения Красной армии, с декабря – начальник политотдела 1-го Орджоникидзевского военно-пехотного училища. После войны полковник С. И. Якимов продолжал служить в училище в той же должности. В августе 1946 г. уволен в запас. Награжден орденом Ленина, 2 орденами Красного Знамени, медалями.