году судимость с него была снята, и с апреля 1930 г. он командовал 36-м отдельным запасным кавалерийским эскадроном 6-й Чонгарской кавалерийской дивизии БВО, а с мая исполнял должность военкома этого эскадрона. В апреле 1931 г. назначен начальником и политруком школы 31-го кавалерийского полка. С апреля 1932 г. по март 1936 г. слушатель Военной академии РККА им. М. В. Фрунзе. После завершения учебы в течение трех лет находился в служебной командировке в Монголии в качестве инструктора дивизии Народно-революционной армии. По возвращении в СССР в августе 1939 г. назначен начальником штаба 12-й кавалерийской дивизии 4-го кавалерийского корпуса КОВО. 5 сентября 1939 г. переведен пом. командира 34-й кавалерийской дивизии в г. Староконстантинов. С июня 1940 г. полковник П. М. Варыпаев командовал 141-й моторизованной дивизией, а с июля 1940 г. 81-й моторизованной дивизией. С началом Великой Отечественной войны дивизия начала выдвижение в район Жолкев (севернее Львова), чтобы совместно с частями 15-го механизированного корпуса нанести удар на Радехов. Но выполнить боевую задачу не удалось, т.к. к этому времени мосты через р. Зап. Буг были уже взорваны. Позже она приняла участие в контрударах под Дубно и Ровно, где понесла большие потери. В ходе этих боев 24 июня полковник П. М. Варыпаев пропал без вести. Воинские звания: майор (30.12.1935 приказ № 01714); полковник (13.01.1939). Награды СССР орден Красного Знамени; медаль «XX лет РККА (22.02.1938).