Целью статьи является анализ феномена гетерогенности при самооценке здоровья для населения России в 2001–2015 гг. с выделением типов гетерогенности и ее социально-экономических детерминант, а также детерминант, связанных со здоровьем. Модель обобщенного порядкового пробита со случайными эффектами с учетом объективного индекса заболеваемости выявила, что детерминантами наблюдаемой гетерогенности в РФ для обоих полов являются семейное положение, доход, неполное среднее образование, проживание за пределами города и в отдельных регионах РФ, для женщин на разброс самооценок здоровья также влияет возраст. Для женщин детерминантами наблюдаемой гетерогенности также является среднее образование, а набор регионов, вносящихся гетерогенность типа сдвига пороговых значений, различается для мужчин и женщин. Исследование показало, что прямое сравнение самооценок здоровья для различных групп населения без учета гетерогенности приводит к неверным выводам.